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牙髓卟啉单胞菌染料法 PCR 试剂盒

发布时间:2025/4/1 10:36:30      阅读次数:24

CAT#:JW-14-42910 低温运输,-20℃保存

 

牙髓卟啉单胞菌染料法 PCR 试剂盒

Porphyromonas endodontalis SYBR qPCR Kit


产品及特点       牙髓卟啉单胞菌( Porphyromonas endodontalis是一种革兰氏阴性细菌,

 1976 年首先从感染牙齿根管中的产黑色素类杆菌群中分离出来,现已被认为是  感染牙齿根管生态环境中的核心细菌之一。而根尖牙乳头干细胞是年轻恒牙牙根生  理性发育与成熟的重要细胞学基础,故牙齿根管细菌感染对其细胞活性的影响关系  着年轻恒牙牙根继续发育的潜能  因此快速检测牙髓卟啉单胞菌具有重要的意义。 本产品是以染料法荧光定量 PCR 技术为基础开发的专门检测牙髓卟啉单胞菌的试  剂盒 ,它具有下列特点:

1.   即开即用  用户只需要提供样品 DNA 模板。

2.   引物经过优化 ,灵敏性高 ,分析灵敏度可以达到 100 拷贝/反应。

3.   提供阳性对照 ,便于制备标准曲线和排除无效实验。

4.   特异性高  引物是根据牙髓卟啉单胞菌高度保守区设计  不会跟其他生物的

DNA 发生交叉反应。

5.   本产品足够 50 次 20μL 体系的染料法荧光定量 PCR 反应。

6.   既可用于定性 ,也可用于定量  于定量时线性范围至少 5 个数量级。

7.   本产品只能用于科研。

规格及成分                                本产品采用 5 孔盒包装

成分

编号

规格

包装

SYBR qPCR MasterMix

990408

0.5 mL

0.5mL 本色盖

荧光 PCR 专用模板稀释液

180701

1 mL

1.5mL 绿盖管

超纯水

210806

1 mL

1.5mL 蓝盖管

牙髓卟啉单胞菌染料法 qPCR 引物混合液

yw14-42910my

100 μL

0.5mL 白盖管

牙髓卟啉单胞菌 qPCR  阳性对照(1E7 拷贝/μL)

pc14-42910

50 μL

0.5mL 黄盖管

使用手册

14-42910sc

1 份

 

运输及保存  低温运输 -20℃保存 ,保存期限 12 个月。

自备试剂  样品 DNA。

使用方法  一、稀释标准曲线样品(以 1E1-1E6 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例)  由于

标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样 品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不 提供活体样品做阳性对照 ,只提供无传染性的 DNA 片段作为阳性对照。

1.   标记 6 个离心管 ,分别为 6  5  4  3 2  1。

2.   用带芯枪头分别加入 45  μL 荧 PCR 专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下

 


 

同)。

3.   在 6 号管中加入 5  μL 1E7 拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1 分  ,得 1E6 拷贝/μL 的标准曲线样品 。放冰上待用。

4.   换枪头,在 5 号管中加入 5  μL 1E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充 分震荡 1 分钟 ,得 1E5 拷贝/μL 的标准曲线样品 。放冰上待用。

5.   换枪头,在 4 号管中加入 5  μL 1E5 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充 分震荡 1 分钟 ,得 1E4 拷贝/μL 的标准曲线样品 。放冰上待用。

6.   重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品 。放冰上待用。

二、样品 DNA 的制备

7.   如果有 N 个样品 ,最好设置 N+2 个提取  多出的一个是 PC(样品制备阳性 对照 一个是 NC(样品制备阴性对照) 。可以用 10μL 第 6 步所得的第 4 号稀释液( 1E4 拷贝/μL)再加上一定量的水使总体积跟核酸纯化试剂盒所要 求的起始样本体积一样  以此作为 PC 。另外用水作为 NC

8.   用自选方法纯化样品的 DNA  本试剂盒跟市场上大多数样品 DNA 提取试剂

盒兼容 ,也可使用本公司的免提取核酸释放剂。

三、染料法 qPCR 反应( 20μL 体系 ,在样品制备室进行)

9.   如果做定量分析并且只做 1 次重复 ,则标记 N+9 个 PCR  ,其中 N+2 个用  于上步得到的 N+2 个样品  1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板 6 个用  于标准曲线 。如果做定性分析 ,并且只做 1 次重复 ,则标记 N+4 个 PCR 管, 其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品  1 个用于 PCR 阴性对照(用水做  模板  1 个用于 PCR 阳性对照(用第 6 步第 4 号管的阳性对照稀释液做模  板) 。下面只以定量分析为例描述操作步骤。

10. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置 完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最 后加):

 

成分

样品管 N+2 

PCR 阴性 对照管

标准曲线

样品管( 1-6 管)

 

SYBR qPCR MasterMix

10 μL

10 μL

 10 μL

牙髓卟啉单胞菌染料法 qPCR 引物混合液

2 μL

2 μL

2 μL

N+2 个待测 DNA 模板

8 μL

不加

不加

超纯水

不加

8 μL

不加

6 步所得标准曲线样品

不加

不加

8μL(2 号样到 2

 


 

 

稀释液( 1-6 号)

 

 

号管,3 号样到 3 号 …)

 

11. 盖上盖子后上机 ,按下面参数进行 PCR

 

过程

温度

时间

预变性

95℃

5 

PCR 反应    35 个循环)

95℃

10 秒

60℃

40 秒(采集 SYBR 通道的荧光信号)

溶解曲线分析

 

qPCR 仪器手册执行

注意 :循环次数不要超过 35 个循环。

四、数据处理

12. 通过溶解曲线分析的结果排除无效数据 。有 Ct  ,但 Tm值跟阳性对照 Tm  不一样的样品(包括对照和待测样品),归为假阳性,数据无效,不予以分析。 Tm 跟阳性对照 Tm 一致的 ,为有效 Ct

13. 如果两种阴性对照的溶解曲线所得 Tm 值跟阳性对照的 Tm 值一样 ,说明环

境或试剂可能有过去的 PCR 扩增产物污染 ,则此次实验无效 ,需要解决污染 问题再进行实验。

14. 如果两种阴性对照(样品制备阴性对照和 PCR 阴性对照)是假阳性 ,可以继 续分析其它样品有效数据。

15. 对定量检测  以阳性对照样品的浓度的 log 值为横轴  以有效 Ct 值为纵轴  绘制标准曲线 。再以待测样品的有效 Ct 值从标准曲线上推算出样品 DNA  度的 log  ,再换算出待测样品的 DNA 浓度。

16. 对定性检测 ,则有有效 Ct 值的为阳性 ,无有效 Ct 值的为阴性。

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