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牙髓卟啉单胞菌染料法 PCR 试剂盒

发布时间:2025/4/1 10:36:30      阅读次数:244

CAT#:JW-14-42910 低温运输,-20℃保存

 

牙髓卟啉单胞菌染料法 PCR 试剂盒

Porphyromonas endodontalis SYBR qPCR Kit


产品及特点       牙髓卟啉单胞菌( Porphyromonas endodontalis)是一种革兰氏阴性细菌,

于 1976 年首先从感染牙齿根管中的产黑色素类杆菌群中分离出来,现已被认为是  感染牙齿根管生态环境中的核心细菌之一。而根尖牙乳头干细胞是年轻恒牙牙根生  理性发育与成熟的重要细胞学基础,故牙齿根管细菌感染对其细胞活性的影响关系  着年轻恒牙牙根继续发育的潜能 , 因此快速检测牙髓卟啉单胞菌具有重要的意义。 本产品是以染料法荧光定量 PCR 技术为基础开发的专门检测牙髓卟啉单胞菌的试  剂盒 ,它具有下列特点:

1.   即开即用 , 用户只需要提供样品 DNA 模板。

2.   引物经过优化 ,灵敏性高 ,分析灵敏度可以达到 100 拷贝/反应。

3.   提供阳性对照 ,便于制备标准曲线和排除无效实验。

4.   特异性高 , 引物是根据牙髓卟啉单胞菌高度保守区设计 , 不会跟其他生物的

DNA 发生交叉反应。

5.   本产品足够 50 次 20μL 体系的染料法荧光定量 PCR 反应。

6.   既可用于定性 ,也可用于定量 。 用于定量时线性范围至少 5 个数量级。

7.   本产品只能用于科研。

规格及成分                                本产品采用 5 孔盒包装

成分

编号

规格

包装

2×SYBR qPCR MasterMix

990408

0.5 mL

0.5mL 本色盖

荧光 PCR 专用模板稀释液

180701

1 mL

1.5mL 绿盖管

超纯水

210806

1 mL

1.5mL 蓝盖管

牙髓卟啉单胞菌染料法 qPCR 引物混合液

yw14-42910my

100 μL

0.5mL 白盖管

牙髓卟啉单胞菌 qPCR  阳性对照(1E7 拷贝/μL)

pc14-42910

50 μL

0.5mL 黄盖管

使用手册

14-42910sc

1 份

无

 

运输及保存  低温运输 ,-20℃保存 ,保存期限为 12 个月。

自备试剂  样品 DNA。

使用方法  一、稀释标准曲线样品(以 1E1-1E6 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例) 。 由于

标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样 品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不 提供活体样品做阳性对照 ,只提供无传染性的 DNA 片段作为阳性对照。

1.   标记 6 个离心管 ,分别为 6 , 5 , 4 , 3 ,2 , 1。

2.   用带芯枪头分别加入 45  μL 荧光 PCR 专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下

 


 

同)。

3.   在 6 号管中加入 5  μL 1E7 拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1 分 钟 ,得 1E6 拷贝/μL 的标准曲线样品 。放冰上待用。

4.   换枪头,在 5 号管中加入 5  μL 1E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充 分震荡 1 分钟 ,得 1E5 拷贝/μL 的标准曲线样品 。放冰上待用。

5.   换枪头,在 4 号管中加入 5  μL 1E5 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充 分震荡 1 分钟 ,得 1E4 拷贝/μL 的标准曲线样品 。放冰上待用。

6.   重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品 。放冰上待用。

二、样品 DNA 的制备

7.   如果有 N 个样品 ,最好设置 N+2 个提取 , 多出的一个是 PC(样品制备阳性 对照) ,一个是 NC(样品制备阴性对照) 。可以用 10μL 第 6 步所得的第 4 号稀释液( 1E4 拷贝/μL)再加上一定量的水使总体积跟核酸纯化试剂盒所要 求的起始样本体积一样 , 以此作为 PC 。另外用水作为 NC。

8.   用自选方法纯化样品的 DNA , 本试剂盒跟市场上大多数样品 DNA 提取试剂

盒兼容 ,也可使用本公司的免提取核酸释放剂。

三、染料法 qPCR 反应( 20μL 体系 ,在样品制备室进行)

9.   如果做定量分析并且只做 1 次重复 ,则标记 N+9 个 PCR 管 ,其中 N+2 个用  于上步得到的 N+2 个样品 , 1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板) ,6 个用  于标准曲线 。如果做定性分析 ,并且只做 1 次重复 ,则标记 N+4 个 PCR 管, 其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品 , 1 个用于 PCR 阴性对照(用水做  模板) , 1 个用于 PCR 阳性对照(用第 6 步第 4 号管的阳性对照稀释液做模  板) 。下面只以定量分析为例描述操作步骤。

10. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置 完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最 后加):

 

成分

样品管 N+2 个

PCR 阴性 对照管

标准曲线

样品管( 1-6 管)

 

2×SYBR qPCR MasterMix

10 μL

10 μL

各 10 μL

牙髓卟啉单胞菌染料法 qPCR 引物混合液

2 μL

2 μL

各 2 μL

N+2 个待测 DNA 模板

8 μL

不加

不加

超纯水

不加

8 μL

不加

第 6 步所得标准曲线样品

不加

不加

各 8μL(2 号样到 2

 


 

 

稀释液( 1-6 号)

 

 

号管,3 号样到 3 号 管…)

 

11. 盖上盖子后上机 ,按下面参数进行 PCR:

 

过程

温度

时间

预变性

95℃

5 分

PCR 反应    (35 个循环)

95℃

10 秒

60℃

40 秒(采集 SYBR 通道的荧光信号)

溶解曲线分析

 

按 qPCR 仪器手册执行

注意 :循环次数不要超过 35 个循环。

四、数据处理

12. 通过溶解曲线分析的结果排除无效数据 。有 Ct 值 ,但 Tm值跟阳性对照 Tm  不一样的样品(包括对照和待测样品),归为假阳性,数据无效,不予以分析。 Tm 跟阳性对照 Tm 一致的 ,为有效 Ct。

13. 如果两种阴性对照的溶解曲线所得 Tm 值跟阳性对照的 Tm 值一样 ,说明环

境或试剂可能有过去的 PCR 扩增产物污染 ,则此次实验无效 ,需要解决污染 问题再进行实验。

14. 如果两种阴性对照(样品制备阴性对照和 PCR 阴性对照)是假阳性 ,可以继 续分析其它样品有效数据。

15. 对定量检测 , 以阳性对照样品的浓度的 log 值为横轴 , 以有效 Ct 值为纵轴 , 绘制标准曲线 。再以待测样品的有效 Ct 值从标准曲线上推算出样品 DNA 浓 度的 log 值 ,再换算出待测样品的 DNA 浓度。

16. 对定性检测 ,则有有效 Ct 值的为阳性 ,无有效 Ct 值的为阴性。

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