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发布时间:2025/9/1 13:47:02 阅读次数:8
CAT#:JW-220167-100
低温运输,-20℃保存
易错PCR试剂盒
产品及特点
易错PCR(error-prone PCR)是利用天然Taq DNA多聚酶不具有3′→5′校对功能的特性,在一定条件下(如不同的dNTP浓度、Mg浓度和MnCl2存在)能够按较高的机率引入随机引入突变而设计。如果有适当的突变选择方法,则可从构建的突变库选出所需突变体,用于人工诱变。本产品就是根据此原理开发得产品,它具有下列特点:
1.即开即用,十分简单方便,尤其在生物制药和酶学研究领域显示出了它的优越性。
2.配方经过精心优化,突变率稳定,突变没有趋向性。易错PCR的突变率为0.66%(±0.13%),详见使用手册疑难解答。
3.比体内基因突变更快捷简单,但如果在PCR引物中设计位点,则可使产物克隆到表达载体,也可以用于体内蛋白活性的筛选。
4.可用于连续易错PCR(sequential error-prone PCR),只需把上一次易错PCR的产物用作下一次易错PCR的模板即可,使每一次获得的小突变累积而产生重要的有益突变。
5.只适用于扩增1kb以下的产物,对于1kb以上的产物,建议分段扩增。
6.本产品足够100次30uL体系的易错PCR反应。
7.本产品只能用于科研。
规格及成分
成份 编号 规格 包装
10×易错PCR Mix(含酶) 220167a 300 uL 0.5mL红色盖
易错PCR专用dNTP 220167b 300 uL 0.5mL黄色盖
易错PCR增强剂 220167c 50 uL 0.5mL白色盖
追加dNTP,0.5mM 220167d 300 uL 0.5mL本色管
易错PCR专用MnCl2 220167e 300 uL 0.5mL绿色盖
使用手册 220167sc 1份 无
本产品使用五孔盒包装
运输及保存
低温运输,-20℃保存, 有效期为一年。
自备试剂
引物、DNA模板、超纯水。
使用方法
1.将自备的PCR引物稀释到10uM。引物是决定易错PCR成败的关键因素,设计引物时要保证其Tm在70℃,长度在25-30nt之间,GC含量在45%-60%之间,3端GC含量低,并且没有发夹结构。
2.用自备引物和自备的常规PCR试剂扩增制备易错DNA模板(常规PCR产物),胶回收并准确确定浓度。注意:易错PCR的模板一定要用胶回收的常规PCR产物,因为胶回收可以把电泳不可见的非特异性扩增片段去除,否则这些片段由于也是用易错PCR引物扩增所得,在易错PCR扩增时也会被扩增,产生竞争抑制,降低靶分子的扩增效率。如果常规PCR制备模板的引物和易错PCR引物不同(类似巢式PCR)则可以避免此问题,但需要合成两对引物。本试剂盒只适用于扩增1kb以下的产物,对于1kb以上的产物,建议分段扩增。
3.将回收的DNA片段(模板)用水稀释到1ng/uL 、10ng/uL和100ng/uL三个浓度。注意:模板使用量是影响突变率的最重要因素,因为模板DNA为非突变DNA,扩增产生的DNA为突变DNA,易错PCR体系跟常规PCR一样,最后会达到扩增平台,最终得到的扩增DNA的量是固定的,因此起始模板DNA使用量越大,则突变DNA在最终得到的总DNA中的相对比例就越低。但模板太少又不容易扩增成功,所以建议同时测试三个模板用量。如果都成功,则优先选用模板浓度低的PCR产物进行分析。
4.设置30uL体系的易错PCR反应。在一干净的PCR管中,加入下列成分。由于Mn离子容易跟其他成分发生沉淀反应,因此上机前最后加MnCl2:
成分 管1 管2 管3
10×易错PCR Mix(含酶) 3 uL 3 uL 3 uL
自备DNA模板 1 uL(1ng/uL) 1 uL(10ng/uL) 1 uL(100ng/uL)
自备易错PCR引物
(10 uM each) 各1 uL 各1 uL 各1 uL
易错PCR增强剂 3 uL 3 uL 3 uL
易错PCR专用dNTP 3 uL 3 uL 3 uL
易错PCR专用MnCl2 3 uL 3 uL 3 uL
补自备超纯水 加到30 uL 加到30 uL 加到30 uL
5.立即按下列参数进行易错PCR:
步骤 参数 循环数
PCR前变性 94℃ 3分钟 循环1次
易错PCR 94℃ 1分钟 循环30-60次
60℃ 1分钟
72℃ 3-10分钟
注:由于易错PCR含高浓度的镁离子,因此引物容易互为模板形成引物二聚体,因此使用60℃为复性温度。在错误碱基掺入后,DNA合成会暂时停滞,因此为了让DNA合成继续,需要延长合成的时间到3-10分钟。易错PCR循环次数越多,突变DNA(扩增产物)与非突变DNA(原始模板)的比例就越高。此外在突变率和模板长度恒定的情况下,扩增次数越多,发生突变的绝对数就越高,在同一模板上发生的突变位点数就越多,所以如果需要,可以做30、35、40、45、50、55、60次7个循环数的比较。
6.易错PCR结束后,各取3uL进行电泳检查。
7.如果有预期大小的PCR产物,则全部电泳,进行胶回收,再进行克隆和测序等后续操作。如果需要增加突变率,可以选择一个突变后的DNA为模板,再进行下一轮易错PCR。
8.如果没有PCR产物,则按下列操作进行追加PCR。
9.在易错PCR管中,加入3uL追加dNTP到27uL剩下的易错PCR体系中,按下表进行追加PCR(chasing PCR)。
步骤 参数 循环数
追加PCR 94℃ 1分钟 循环20次
60℃ 1分钟
72℃ 1分钟
10.追加PCR结束后,再电泳检测。如果有条带,再进行克隆和测序等后续操作。如果需要增加突变率,可以选择一个突变后的DNA为模板,再进行下一轮易错PCR。
11.如果没有预期大小的PCR产物,则需要分析原因。
疑难解答
Q:易错PCR的错误率是多少?
A:易错PCR的突变率为0.66%(±0.13%),对500 bp的PCR产物,相当于有4%的PCR片段为野生型,12%的含一个突变,20%的含两个突变,22%的含三个突变,18%的含四个突变,12%的含五个突变,12%的含六个或更多突变。
Q: 如果需要每个核苷酸有高于0.66%的突变率,如何办?
A: 可以使用连续多次易错PCR来提高突变率。但最好先用胶纯化回收PCR片段,再用于下一轮PCR。
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