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高等植物内源tRNALeu基因荧光及可视化LAMP试剂盒

发布时间:2025/12/1 11:52:21      阅读次数:4

CAT#:JW-16-GMO0002
低温运输,-20℃保存

高等植物内源tRNALeu基因荧光及可视化LAMP试剂盒

产品及特点
在对高等植物进行GMO基因检测的时候,往往需要同时对高等植物的一个内源基因进行检测,此内源基因就相当于内源性内参,如果靶基因检测结果为阳性时,内源基因的检测结果是阴是阳均不影响对靶基因的结果判断。但当靶基因检测结果为阴性时,内源基因的结果就是判断靶基因是真阴性还是假阴性的关键。如果一个样本靶基因是阴性,内源基因也是阴性,则可能是由于扩增抑制物等因素导致的阴性,不能排除靶基因是假阴性,因此本样本需要重测。如果一个样本靶基因是阴性,内源基因是阳性,则说明扩增有效,靶基因是真阴性。因为在对高等植物进行GMO基因检测的同时,同时对其内源基因进行相同的检测具有重要的意义。为此本公司根据双染料LMAP技术,开发了高等植物内源tRNALeu基因检测试剂盒,它具有下列特点:
1.即开即用,用户只需要提供DNA样品。
2.含可见光和荧光染料,既可以用金属浴和水浴扩增用可见光肉眼判断结果,也可用荧光PCR仪进行实时荧光检测。
3.检测灵敏性一般比PCR高10倍以上。
4.特异性高,根据高等植物内源tRNALeu基因保守序列设计特异引物,不会跟其他生物的DNA发生交叉反应。
5.上样量大,对20mL的反应体系,最大样品加样量高达到14mL。
6.提供阳性对照,便于分析实验结果。
7.一般跟GMO靶分子结合使用,用于判断靶分子的阴性检测结果是真阳性还是假阳性,不能用于定量分析。
8.本产品足够50次20mL体系的荧光及可视化LAMP扩增。
9.本产品只可用于科研。

规格及成分
本产品采购五孔盒包装
成分               
                                                                                    编号            规格            包装
4×LAMP MasterMix(可视化染料-荧光染料双染料法,待加酶)    211223   
       200mL    0.5mL绿盖管
Bst DNA聚合酶2.0       
                                                                 11-220319        50mL    0.5mL红盖管
20×高等植物内源tRNALeu基因LAMP引物混合液干粉           yw16-GMO0002     50次   
    0.5mL白盖管
高等植物内源tRNALeu基因LAMP阳性对照(1×10E4拷贝/mL)pcGMO0002      250mL    0.5mL黄盖管
超纯水           
                                                                               210806             1 mL       1.5mL蓝盖管
使用手册           
                                                                         16-GMO0002sc    1份          
注意:首次使用本试剂盒时,需要加入55mL超纯水到引物干粉管中,涡旋震荡半分钟混匀,得到20×引物混合液。短暂离心后即可使用。未用完的需要放-20℃保存。

运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为一年。

自备试剂
待测样品。

使用方法
一、样品DNA的制备
1.用自选方法纯化样品DNA,本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容,包括本公司的免提取的核酸释放剂。
2.如果有N个样品,则需要做N+2个样品制备,包括一个样品制备阳性对照(PC)和一个样品制备阴性对照(NC)。PC用10mL本试剂盒提供的阳性对照(1×10E4拷贝/mL)加一定量的水作为样品制备PC,加水后的总体积跟所用核酸纯化试剂盒所要求的起始样本体积一致。NC用水替代。

二、LAMP反应(20mL体系)
3.反应设置:第一次使用时请把所有Bst DNA聚合酶2.0(50mL,本试剂盒提供)加入到4×LAMP MasterMix(可视化染料-荧光染料双染料法,待加酶)中,轻柔颠倒20次充分混匀,然后再取用。如果有N+2个DNA纯化样品,则最好设置N+4个LAMP扩增,增加LAMP扩增阳性对照和LAMP扩增阴性对照各1个。在N+4个PCR管中加入下列成分:
成分           
                                                                                N+2个样品管    LAMP阴性对照    LAMP阳性对照
4×LAMP MasterMix(可视化染料-荧光染料双染料法,已加酶)    各5 mL   
        5 mL                       5 mL
20×高等植物内源tRNALeu基因LAMP引物混合液   
                        各1 mL           1 mL                       1 mL
N+2个样品DNA       
                                                                        各14 mL            -                               -
超纯水           
                                                                                        -                14 mL                         -
本试剂盒提供的阳性对照   
                                                                    -               -                                14mL
4.如果使用金属浴或水浴保温,没有热盖,则每个反应管中加入50mL自备的PCR级石蜡油,否则保温期间反应体系的水分会蒸发到管盖下方凝集,反应体积变化,会严重影响反应效率,增加假阳性率。最后置于65℃保温60分钟进行扩增。
5.如果使用常规PCR仪进行LAMP反应,设置程序时必须打开热盖,设置成65℃保温60分钟进行扩增。
6.如果使用荧光定量PCR仪,则设置60次循环,每次65℃保温1分钟,采集SYBR通道的荧光信号。

三、结果分析
7.电泳分析:由于取样时非常容易产生气溶胶污染,污染实验环境并且非常难清除污染,所以强烈建议不要采取此方法分析实验结果。即使使用,也要在不同的房间,使用不同的移液枪操作。具体做法是取10mL LAMP扩增产物跟自备上样液混合后进行2%琼脂糖凝胶电泳。LAMP阳性对照必须有正常LAMP条带(200bp左右的梯形扩增产物),LAMP阴性结果必须无条带,否则实验结果无效。如果LAMP阳性对照和阴性对照结果正常,再分析待测样品。典型的电泳结果见下表,奇数样为阴性结果,偶数样为阳性结果:

8.可见光(肉眼)分析:样品制备阳性对照和LAMP阳性对照的反应液将呈蓝色,样品制备阳性对照和LAMP阳性对照的反应液将呈淡蓝色或无色,否则提取实验或扩增实验无效。如果阳性和阴性对照结果正常,则实验有效,可以分析样品的情况。样品管的颜色接近扩增阳性对照管则说明样品为阳性,如果接近阴性对照则说明待测样品为阴性。典型的可见光检测结果见下图(9为阴性,10为阳性)。

9.荧光分析(仅限于用qPCR仪进行反应的场景):样品制备阳性对照和LAMP阳性对照的反应液将有标准的S扩增曲线,样品制备阴性对照和LAMP阴性对照的反应液将没呈平线,没有S曲线,否则提取实验或扩增实验无效。如果阳性和阴性对照结果正常,则实验有效,可以分析样品的情况。样品管的荧光曲线为S型,则说明样品为阳性,如果为平线则说明待测样品为阴性。典型的荧光检测结果见下图。左边为阳性,右边为阴性。

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