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人BRAF基因c.1799T>A(V600E)点突变探针法qPCR检测试剂盒

发布时间:2025/12/3 16:15:14      阅读次数:7

CAT#:JW-15-rs113488022
低温运输,-20℃保存

人BRAF基因c.1799T>A(V600E)点突变探针法qPCR检测试剂盒

产品及特点
BRAF基因位于人7号染色体上,该基因编码RAF家族丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。该基因编码的蛋白在调节MAPK/ERK信号通路中起作用,影响细胞分裂,分化和分泌。BRAF基因最常见的突变为1799T>A(V600E),常在黑色素瘤,非霍奇金淋巴瘤,大肠癌等肿瘤疾病中发生突变。人BRAF基因的15号外显子1799T>A(V600E)点突变与多种肿瘤疾病有关,因此研究1799T>A突变具有重要的研究意义,为此本公司开发了专门检测1799T>A突变的探针法qPCR检测试剂盒,它具有下列特点:
1.即开即用,用户只需要提供样品DNA模板。
2.引物和探针经过优化,分析灵敏性高,可以达到1000 拷贝/μL。
3.分辨率高,能检测出5 %的点突变。
4.一管式检测,突变型探针用FAM标记,野生型探针用Cy5标记。
5.同时提供野生型和突变型两种阳性对照,便于排除假阴性样品。
6.特异性高,引物和探针是根据人BRAF基因1799T>A突变设计,不会跟其他突变发生交叉反应。
7.本产品只能定性,不能定量。
8.本产品足够50次20 μL体系的点突变探针法荧光定量PCR反应。
9.本产品只能用于科研。

规格及成分
本产品采用5孔盒包装
成分           
                                       编号               规格       包装
2×SNP ProbeqPCR MasterMix     231222   
        0.5 mL    0.5 mL本色盖
超纯水          
                                  210806          1 mL       1.5 mL蓝盖管
人BRAF基因rs113488022位点
检测引物-探针干粉    ywpb15-rs113488022  
        50 次    0.5 mL白盖管
人BRAF基因15号外显子
野生型阳性对照(1E4拷贝/μL)    pc-rs113488022wt    250 μL    1.5 mL棕色管
人BRAF基因rs113488022位点突变型
阳性对照(1E4拷贝/μL) 
           pc-rs113488022mt    250 μL    0.5 mL黄盖管
使用手册       
                        15-rs113488022sc    1份    无
注意:使用前需要将引物探针干粉管短暂离心后加入220 μL的自备超纯水,震荡混匀后再取用,一次没用完剩下的需要放-20℃保存。

运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。

自备物品
样品DNA。

使用方法
一、样品DNA的制备
1.如果有N个样品,则进行N次纯化,得到的DNA最后溶解在TE中,并需要用NanoDrop进行定量。最后的浓度不能低于0.2 μg/μL。
2.本试剂盒跟市场上大多数样品DNA提取试剂盒兼容。

三、点突变Probe qPCR反应(20 μL体系,在样品制备室进行)
3.如果只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N个用于上步得到的N样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板,NC),3个用于阳性对照(PC)。
4.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子后最后加):
成分      
                                      样品管N个    扩增NC    野生型PC    杂合型PC    突变型PC
2×SNP Probe qPCR MasterMix    各10 μL    10 μL   
    10 μL            10 μL           10 μL
rs113488022位点
检测引物-探针混合液   
                各4 μL        4 μL           4 μL           4 μL               4 μL
N个DNA样本   
                            各3 μL                
超纯水   
                                        各3 μL        6 μL          3 μL                                   3 μL
人BRAF基因15号外显子
野生型阳性对照(1E4拷贝/μL)           
                                   3 μL            3 μL    
人BRAF基因rs113488022位点突变型
阳性对照(1E4拷贝/μL)             
                                                              3 μL                3 μL
5.盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:
过程       
         温度    时间
预变性     
       95℃    90 sec
PCR反应
(45个循环) 95℃    15 sec
    
                   60℃    60 sec(采集FAM和Cy5通道的荧光信号,淬灭基团均为TAMRA)

五、数据处理
6.实验有效性的判断:首先分析扩增NC是否有FAM或/和Cy5信号,如果有则表示实验污染,本次实验无效,无需分析所有实验数据,需要寻找原因。如果无则表示实验没有污染,再分析三个PC。如果突变型PC没有FAM扩增信号(有标准的倒S扩增曲线,下同),或野生型PC没有Cy5扩增信号,或杂合型PC没有FAM和Cy5扩增信号,则表示实验无效,不需要分析样本的数据,需要分析原因。如果三个PC正常(突变型PC有FAM扩增信号,野生型PC有Cy5扩增信号,杂合型PC有FAM和Cy5扩增信号),则实验有效,可以分析样本的数据。
7.如果荧光定量PCR仪有基因分型的自动分析模块,则进入该模块,获得每个样本的FAM值/Cy5值的荧光比值,并根据荧光比值描出散点图。荧光比值位于散点图的X轴方向的样本可以判为突变型,荧光比值将位于Y轴方向的样本可以判为野生型,荧光比值位于X轴和Y轴中间的可以判为杂合子。扩增NC的荧光比值将位于原点附近。散点图的示例如下:

8.如果荧光定量PCR仪没有基因分型的自动分析模块,则需要手动分析。首先根据Ct值判断每个样本在FAM和Cy5两个通道的扩增情况。如果FAM通道的Ct低于35,则算FAM信号有扩增。如果Ct大于35或没有Ct,则算FAM通道无扩增。Cy5通道也如此操作。然后根据扩增结果按下表判断每个样本的基因型,得到无效数据的样本需要重复:
FAM通道    Cy5通道    基因型判断
有扩增   
     无扩增        突变型
有扩增  
      有扩增        杂合子
无扩增   
    有扩增        野生型
无扩增 
        无扩增       阴性PC或无效数据

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