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miRNA 染料法 qRT-PCR 试剂盒(polyA 加尾法)

发布时间:2024/6/19 9:31:23      阅读次数:95

CAT#:JW-931042-25
低温运输,-20℃保存

产品及特点    
本试剂盒采用E.coli polyA聚合酶对miRNA加尾 ,然后用特异引物进行逆转录 ,最后用荧光定量PCR试剂盒进行定量检测 ,其原理示意图如下:

本产品具有下列特点:
1.两步法(加尾-逆转录、染料法 qPCR),一步完成加尾-逆转录 ,然后检测多个 miRNA 靶分子 。一次加尾-逆转录反应得到的 cDNA 可以做上百次 PCR。
2.直接用总 RNA 为模板 ,不需要专门纯化 miRNA ,简单快捷。
3.检测灵敏度可以达到几百个拷贝/反应。
4.能区分有 2-3 个碱基不同的 miRNA。
5.既可以定性 ,也可以定量 。定量时线性范围至少有 5 个数量级 ,但需要自备标准品。
6.既可以用总 RNA 为模板 ,也可以用总 miRNA 为模板。
7.用户需要自备 miRNA 专一性的一条 PCR 上游引物。
8.本产品足够 25 次 20uL 体系的加尾和逆转录反应,100 次 20uL 体系的染料法qPCR。
9.本产品只能用于科研。

规格及成分    本产品使用十孔盒包装
成分                                                                      编号          规格        包装材料
加尾和逆转录 Mix(含 dNTP 和 ATP)             931042a        150 μL        0.5mL 绿盖管
miRNA-polyA RT 引物                                       931042b        干粉        0.5mL 本色管
E.coli polyA 聚合酶和M-MLV逆转录酶混合液    931042c        40 μL        0.5mL 红盖管
miRNA PCR 通用下游引物                                931042d        干粉        0.5mL 黄色管
2×SYBR PCR MasterMix                                    990408        1 mL        0.5mL 棕色管
超纯水                                                                980403        1 mL        2.0mL 蓝盖管
使用手册                                                            931042sc        1 份        无
注意:上表的两个引物用前需要加入 30uL 的超纯水充分溶解混匀后才可使用。

运输及保存    低温运输 ,-20℃保存 ,有效期一年。

自备试剂    总 RNA、miRNA 专一性上游引物(5pmol/μL in 水中)

使用方法    
一、 设计、合成和分析自备的 miRNA 专一性上游引物
1.本试剂盒需要用户自行设计一条 miRNA 靶分子专一性的上游引物跟试剂盒提供的通用引物共同使用 ,用超纯水稀释到 5pmol/μL 待用。
2.miRNA 专一性上游引物的 Tm 值决定后续 PCR 的复性温度 ,非常重要 ,故 必须准确。可以通过网上的在线分析软件(如oligoanalyzer)计算 Tm,但最 好实验测定 ,做法是将 100pmol miRNA 专一性上游引物和等量的互补引物 (不是下游引物) 在 20μL 的本试剂盒提供的 2×SYBR PCR MasterMix 反应 体系中混合(参考第 9 步 ,只是不加模板 ,其他成分都加) ,直接进行溶解 曲线分析, 测出在本试剂盒提供的反应体系中的 Tm 值 。当软件计算的 Tm值和实验测试的 Tm 值有差异时, 以后者为准。
3.miRNA 专一性上游引物最好在 3 端比 miRNA 短几个碱基。
4.可以选择一个所研究物种的 5.8S rRNA 作为内参 ,设计一条 5.8S rRNA 专一性的引物, 同时做平行实验。

二、 准备总 RNA
5.用自选方法和试剂纯化总 RNA, 测定其浓度, 最后用超纯水将其稀释到 100ng/μL 。 总 RNA 样品 中残 留的 DNA 污染 由于 并没 有下游通用 引物 (miRNA-polyA RT 引物) 的结合位点 ,所以一般不会干扰基于本方法的miRNA PCR 检测。

三、 加尾及逆转录反应
6.按下表设置 RNA 加尾和逆转录反应, 以 1 个样品为例:

加入组分                                                                 体积
自备的总 RNA ,100ng/μL                                   2.0 μL
加尾和逆转录 Buffer(含 dNTP 和 ATP)            5.5 μL
miRNA-polyA RT 引物                                            1.0 μL
E.coli polyA 聚合酶和M-MLV 逆转录酶混合液        1.5 μL
合计                                                                         10 μL
7.37℃保温 1 小时。
8.加入 190μL 超纯水使得总体积为 200μL(稀释 20 倍) ,此样品将作为 cDNA模板用于 PCR 。未用完的 cDNA 20 倍稀释样品可以放-20℃至少两年以上。

二、染料法 qPCR
9.按下表设置染料法 qPCR 反应 ,最好每个反应设置 3 个重复:

加入组分                                                    体积
2×SYBR PCR MasterMix                           10 μL
自备 Forward Primer ,5pmol/μL                 1 μL
miRNA PCR 通用下游引物 ,5pmol/μL       1 μL
第 8 步所得 miRNA cDNA 20 倍稀释液       1 μL
超纯水                                                          7 μL
10.  建议反应程序设置如下:

循环                                     温度                           时间

PCR45次                            95℃                         15 秒
                      (miRNA 特异 引物 Tm-5) ℃      15 秒
                                            72℃                         20 秒
溶解曲线分析       根据 PCR 仪要求设定
11.  分析溶解曲线分析所得 Tm(在 70-80℃之间一般表示扩增是特异的),分析Ct 值,分析标准曲线的斜率和 R2(如果用阳性对照做了标准曲线反应的话)。

关联产品    miRNA 纯化试剂盒


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