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古细菌探针法 qPCR 试剂盒(不含内参)

发布时间:2024/7/4 9:10:01      阅读次数:8

CAT#:JW-15-68801低温运输,-20℃保存

古细菌探针法 qPCR 试剂盒(不含内参)       Archaea Probe qPCR Kit                      

产品及特点    
古细菌(Archaea)是指远古时代特殊生态环境下生活的细菌 ,其生活习性 和化学组成都很特殊 。大多数古细菌生活在极端环境 ,如盐分高的湖泊水中 ,极 热、极酸和绝对厌氧的环境 ,有的在极冷的环境生存 。该菌细胞壁不含肽聚糖, 细胞膜的脂类与其他任何生物都不一样,RNA 聚合酶和核糖体中的一种蛋白质都 和真核细胞相似而和原核细胞不同 。 古细菌可能是地球形成初期古老细菌的代 表 ,保持了古老的形态 ,很早就和其他细菌分道扬镳 。古细菌的研究有助于对于 古生物的探索,因此快速检测古细菌具有重要的意义。本产品就是以探针法 qPCR技术为基础开发的专门检测古细菌的试剂盒 ,它具有下列特点:
1.   即开即用 , 用户只需要提供样品 DNA 模板。
2.   引物和探针经过优化 ,分析灵敏性高 ,可以达到 100 拷贝/反应。
3.   提供阳性对照 ,便于区分假阴性样品。
4.   特异性高,引物是根据古细菌 DNA 高度保守区设计,不会跟其他生物的 DNA发生交叉反应。
5.   既可用于定性检测 ,又可用于定量检测 。 用于定量检测时线性范围至少为 5个数量级。
6.   本产品足够 50 次 20μL 体系的探针法荧光定量 PCR 反应。
7.   本产品只能用于科研。

规格及成分    
本产品采用五孔盒包装
成分                                                                      编号           规格              包装
2×Probe qPCR MasterMix                                  981201        0.5 mL      0.5 mL 本色盖
荧光 PCR 模板专用稀释液                                 180701         1 mL         1.5 mL 绿盖管
超纯水                                                               210806           1 mL         1.5 mL 蓝盖管
古细菌 qPCR 引物-探针干粉                        yp15-68801am    50 次        0.5 mL 白盖管
古细菌 qPCR 阳性对照 ( 1×10E7 拷贝/μL)        pc68801         50 μL       0.5 mL 黄盖管
使用手册                                                           15-68801sc     1 份                  无
    
注意:引物-探针干粉在使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入 165 μL 的超纯水充分混匀后再使用 ,未用完的需要-20℃保存。
运输及保存:低温运输 ,-20℃保存 ,保存期限为 24 个月。
自备物品:样品 DNA。

使用方法    
一、稀释标准曲线样品(以 10E1- 10E6 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例)。
由于标准品浓度非常高 , 因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行 ,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分) 。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原 , 本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的 DNA 片段作为阳性对照。
1.   标记 6 个离心管 ,分别为 6 , 5 , 4 ,3 ,2 , 1。
2.   用带芯枪头分别加入 45  μL 荧光 PCR 专用模板稀释液 ,最好用带芯枪头,下同)。
3.   在 6 号管中加入 5  μL 1×10E7 拷贝/μL  的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1 分钟 ,得 1×10E6 拷贝/μL 的标准曲线样品 。放冰上待用。
4.   换枪头 ,在 5 号管中加入 5  μL 1×10E6 拷贝/μL  的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
5.   换枪头 ,在 4 号管中加入 5  μL 1×10E5 拷贝/μL  的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E4 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
6.   重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品 。放冰上待用。

二、样品 DNA 的制备
7.   如果有 N 个样品,最好设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性 对照) ,一个是 NC(样品制备阴性对照) 。可以用 10μL 上步所得 4 号稀 释液再加上一定量的水使总体积跟核酸制备试剂盒所要求的起始样本体积
一样 , 以此作为 PC 。另外用水作为 NC。
8.   用自选方法纯化样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数样品 DNA 提取试剂盒兼容 。也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。

三、Probe qPCR 反应(20μL 体系 ,在样品制备室进行)
9.   如果做定量分析并且只做 1 次重复 ,则标记 N+9 个 PCR 管 ,其中 N+2 个 用于上步得到的 N+2 个样品 , 1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板) , 6 个用于标准曲线 。如果做定性分析并且只做 1 次重复 ,则标记 N+4 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品 ,1 个用于 PCR 阴性对照(用 水做模板) , 1 个用于 PCR 阳性对照(直接用第 6 步第 4 号管的阳性对照稀释液做模板) 。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
10. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复 。样品管和阴性对照设 置完毕后才设置阳性对照 ,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
成分                                                            样品管N+2 个          PCR阴性对照          标准曲线样品管( 1-6 管)
2×Probe qPCR MasterMix                            各 10 μL                       10 μL                      各 10 μL
古细菌 qPCR 引物-探针混合液                      各 3 μL                         3 μL                        各 3 μL
N+2 个待测 DNA 样本                                    各 7 μL                        不加                         不加
超纯水                                                                不加                         7 μL                         不加
第 6 步所得标准曲线样品稀释液( 1-6 号)      不加                         不加         各 7μL( 2 号样 到 2 号管 , 3 号 样到 3 号管 …)

11. 盖上盖子后上机 ,按下面参数进行 PCR:
过程                                   温度               时间
预变性                                95℃             2 min
PCR 反应(40 个循环)    95℃            15 sec
                                           58℃        30 sec(采集 FAM 通道的荧光   信号 ,设置 BHQ- 1 为淬灭基团)
四、数据处理
12. 如果样本制备阳性对照或 PCR 阳性对照(包括标曲样本)结果为阴性,则整个 实验无效 , 不需要分析数据 , 需要重新样本制备 ,重新进行 PCR 扩增或跟 厂家联系 。如果样本制备阴性对照或 PCR 阴性对照结果为阳性 ,说明环境污染 ,则整个实验无效 ,不需要分析数据 ,需要跟厂家联系。
13. 如果阴性对照和阳性对照均正常 ,则实验有效 ,可以进入后续分析。
14. 如果把本试剂盒用于定量检测 , 则以阳性对照浓度的 log 值为横轴 , 以 Ct 值为纵轴 ,绘制标准曲线 。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品DNA 浓度的 log 值 ,再推算出其浓度。
15. 如果把本试剂盒用于定性检测 , 只判断阳性或阴性 , 则阴性对照必须无 Ct 或 Ct 大于或等于 40 。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线 ,Ct 值应该小于 40 ,否则实验无效 。如果实验有效 ,则分析待测样品 ,如果无Ct 或 Ct 大于或等于 40 ,则为阴性 。如果 Ct 小于 40 则为阳性。

关联产品  古细菌可视化染料-荧光染料 LAMP 试剂盒


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